虽然医院可以适当利用医院资金进行合理投资，但是大多数医院的投资存在盲目性和跟风性，且各类投资项目建设存在诸多乱象与不合理，片面追求经济效益而忽略了社会效益，项目融资的不合理安排，项目投资的不科学增加了医院的投资风险。此外，医院在进行重大项目和设备采购时，没有从长远角度做好规划与调研，导致以较高的成本和代价购置不适用或与持续需求不相匹配的医疗器材，造成资产的浪费和利用率低下，使得医院基本建设项目投资成本增加，建设项目无法正常完成或造成无效投资现象。
2.1.2 流动资金不充足
医院的总资产构成除了基建项目，大部分是由各类耗材、设备、器械和药品组成，这些项目购置不合理，会在很大程度上造成医院资金流动不畅和阻滞，并使得医院部分医用设备和药品存货大量积压，不仅需要投入大量的资金用于医疗库存资源的保管，还要耗费大量的人力资源，最终导致医院经济效益下降，医院财务成本管理费用上升。
2.1.3 医院成本核算体系不完善
现阶段，我国医院的财务成本核算体系还不是很完善，传统的核算方式与现代医院经营发展相对滞后，更不符合医院的财务管理要求。目前医院财务核算系统得到大幅提升，但医院的成本控制和管理仍存在着诸多不完善的地方，导致医院的运营管理成本始终处于较高水平，对成本费用的结算也缺乏科学的规划与合理的分析，对高成本的原因没有得到科学分析与改善，利润空间始终得不到拓展，最终导致医院成本核算在财务活动中不能得到落实与管控[1]。
2.1.4 财务人员的专业素质不高
随着我国医院发展规模的不断壮大，医院财务管理人员的专业技能及技术水平已经无法跟上医院发展的步伐。目前，我国医疗体系中普遍存在财务管理专业人才短缺的现象，这严重地影响了医院的长期可持续发展。同时，由于不少医疗单位的财务管理人员年龄偏大、综合素质不高，对财务管理知识和业务技能学习不够，造成了单位财务管理不规范。因此，需要不断地对财务人员进行管理知识和技能培训。还有一些财务人员缺乏全面的专业知识结构，个人财务管理素质不高，对财务管理工作不够重视，这些都阻碍了医院财务工作的现代化管理，影响医院顺利构建完善的财务管理体系[2]。
2.2 医院财务管理问题的原因分析