预算执行是体现新事业单位财务报表的科学性的一项重要衡量指标。通过对财务报表体系进行分析，准确的得出预算执行的真实情况，这是在旧会计制度的财务较为少见的特征。新的会计制度注意到了预算执行的重要性，因此强调了单位的预算执行情况。通过预算执行情况分析，则能够较为直观和准确的判断出单位的财务活动是否健康的运行，从而得出整个单位的管理效率是否能与事业单位发展目标相匹配。
二、我国事业单位财务报表体系存在的几个问题
（一）事业单财务报表体系中资产负债表存在的问题
我国事业单位的资产负债表不同于企业的资产负债表。其采用的财务恒等式为“资产+支出=负债+净资产+收入“。这实际上并不符合国际上资产负债表的定义，而仅仅只能对事业单位财务情况作出静态、事后的反应。实际上，事业单位的资产负债表的灵魂依旧是以资金为核心。同时，收入支出表对此却是做出了实质性补充，即收入支出表实际上反应的事业单位的资产负债表上某两个不同时点、时期上的财务动态变化情况。在我国《事业单位财务规则》的要求下，事业单位左方列示资产与支出，右方则列示负债和净资产、收入这三项，如此就使得左右方都恒等。而问题就随着而来，如此不分明细的列示，其实际上就把事业单位的静态和动态混淆了，使得会计信息的可理解性原则得不到保证，信息也因此而出现了模糊性，同时也使得资产负债的不能体现会计信息明晰性要求。此外，事业单位的资产负债表还存在一个较为重要的缺陷，即不能反映如实的披露单位的资产与负债之间的对等关系。这就使得事业单位受到监督的可能性减少，从而不利于国有资产管理的透明化等问题的发现。
（二）事业单财务报表体系中与资金相关的报表存在的问题
关于事业单财务报表体系中与资金相关的报表存在的问题主要表现在以下两个方面。一个方面是，事业单位的收入支出表存在的问题。收入支出表在新旧会计制度都十分重要的一份财务报表，实际上是对事业单位的收入支出以及结余的动态分析表，也是事业单位财务报表体系中与资金息息相关的一种财务报表。在我国事业单位中收支恒等式为“收入-支出=结余”，可在实务报表中，事业单位往往使得该等式出现不平衡现象：如“拨入专款”、“专款支出”、“拨出专款”三个项目中，第一个作为收入列示，第二、第三个则是支出项目，如此相减，实际上就不会出现结余这一项。这就使得事业的预算数与实际数不对称，预算执行情况得不到如实反映，资金的管理存在缺陷。另一个方面，事业单位的财务报表体系中，并没有详细的编写现金流量表，如此就无法反映事业单位一定会计时期的资金变化情况。管理层也无法了解自身真实的资金周转情况，必然对资金缺乏有效的管理。虽然新事业单位会计制度引进了权责发生制，但是由于缺乏科学的现金流量表编写依据，事业单位的财务报表关于缺失现金流量表的问题依旧存在。（三）事业单位财务报表体系存在的其他问题
事业单位财务报表体系存在的其他问题实际上就是等同于企业财务报表体系里面的附注不明确。对于单位的会计管理核算的部门预算和国库集中收付制度专用解析的财务报表都无法提供较为详细的会计信息。随着新事业单位会计制度对部门预算与国库集中收付的逐渐重视，这二者在事业单位的会计活动中地位逐渐上升。但事业单位财务报表体系并没有相应反应预算执行的情况说明，这就会很大程度上限制了事业单位财务报表体系的使用以及信息反映。
三、完善我国事业单位财务报表体系若干对策
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