通过电子监察系统，实现对全校的行政效能、行政事项审批、办事过程、党务政务公开等行为的动态监督，实现实时监控、时效监察、预警纠错、绩效评估和校内互动。
（一）实时监控。一是自动采集每项重要工作、事项审批、事项办理过程的详细信息，即时、同步、全面监控实施全过程。
（二）预警纠错。系统对事项审批、办事过程的超时效行为和违规行为分别给予“黄牌”、“红牌”警告，通过网络邮箱、手机短信自动通知相关部门和责任人员及时处理或纠正，不断提高学校的行政效能。甚至可以结合廉政风险防控工作，在事项流程的的关键节点提醒廉政风险，设置条件防范廉政风险。
（三）绩效考核。系统可对进行部门之间和本部门不同岗位的工作量、办结效率进行统计，结合群众投诉等情况进行绩效考核。根据考核结果，对相关责任部门和个人进行奖惩。每月或季度发布电子监察效能报告。
（四）校内互动。对网上各类投诉进行受理、督办和回复；开展网上调查，组织群众对部门的服务质量进行评估等；在系统适当位置公开行政事务情况，提高群众知情权和参与监督的积极性。
三、高校建设电子监察系统可能遇到的问题
1、认识不足，重视不够。电子监察系统主要功能是提高行政效能，提高机关的服务质量和效率，为学校发展提供一个良好的行政服务系统。但是，部分部门和人员认为电子监察系统监督和约束了自己的权力，不愿将部门工作事项纳入电子监察系统运行。部分领导对建设电子监察系统重视不够，没有认识到电子监察系统是信息时代开展行政监察、提高行政效能、建设服务型、廉洁型机关的必然趋势。
2、建设理念不统一。电子监察系统对于高校仍然是一个新事物，没有现成的建设标准和组成构建，基本是各学校自行推动。因此，对于电子监察系统的主要功能、建设思路、工作重点、如何运行等方面都需要摸索，认识都不一致。
3、存在双轨运行问题。一些部门不愿将工作事项放在在电子监察系统办理，逃避监督。有的部门选择性在系统上运行部分事项，不愿接受监督的仍按传统方式办理，有的甚至所有事项都不放在系统运行。这里有主客观两方面的原因，客观原因是多年来都按照传统纸质模式工作，短时间不能适应新的工作模式，比如有个别工作人员学习新系统操作困难的问题，有系统功能跟不上需要的问题，也有担心电子监察系统的安全问题。主观方面的原因是个别部门不愿接受电子监察系统的监督，怕权力阳光运行后受到制约，失去权力带来的成就感和“好处”。
4、缺乏科学的绩效考核制度和责任追求制度。电子监察系统要健康运行，必须要有配套的绩效考评制度和责任追究制度，要能够激励各单位、部门将工作事项纳入系统办理，并能使工作人员高质量高效率完成任务，又能对消极怠慢、违规违纪操作行为追究责任。目前，在这方面还没有比较科学和完善的制度和办法。
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